本病的病原体为淋球菌，系革兰氏阴性球菌，多寄生在淋病患者的泌尿生殖系统。淋球菌表面含有粘附因子，它不但能粘附和侵入粘膜上皮，而且能引起粘膜上皮细胞的损伤、坏死和脱落，造成皮下结缔组织或粘膜下层的扩散性感染病灶，菌毛和淋球菌表面的白细胞协同因子能对抗机体吞噬细胞的吞噬作用，同时还可抵抗抗体和补体的杀伤作用，这样淋球菌能在感染病灶内大量生长繁殖，并可沿泌尿生殖管蔓延扩散。
中医认为，宿娼恋色或误用污染之器具，湿热秽浊之气由下焦前阴窍口入侵，阻滞于膀胱及肝经，局部气血运行不畅，湿热薰蒸，精败肉腐，气化失司而成本病。日久及肾，导致肾虚阴亏，瘀结内阻，病程日久，由实转虚，形成虚证或虚实夹杂之证。